Die Mühle aus dem 16. Jahrhundert liegt im Herzen der Merian Gärten. Obwohl seit 1980 hier kein Getreide mehr gemahlen wird, ist das wasserbetriebene Mühlenrad noch in Betrieb. Im Museum lässt sich das eindrückliche Triebwerk bestaunen und in der Mahlstube kann man sich gut vorstellen, wir hier zu Zeiten Christoph Merians Weizen, Dinkel und Roggen gemahlen wurde. Historische Ausstellungsstücke zeigen ausserdem die Entwicklung der Müllerei vom bronzezeitlichen Handwerk bis zur industriellen Produktion.